深度蛋白质组学是一种致力于最大限度解析生物样本中蛋白质种类、表达水平、翻译后修饰及相互作用的前沿蛋白质组学技术。相较于传统蛋白质组学分析，深度蛋白质组学通过高灵敏度、高分辨率的质谱技术，结合优化的样本制备、分离策略及数据分析方法，能够更全面、更精准地解析生物体系的蛋白质组信息。在生命科学研究中，蛋白质是细胞执行功能的核心分子，而不同组织、细胞类型及生理状态下的蛋白质组成和修饰模式存在显著差异。传统蛋白质组学研究通常受限于检测灵敏度和覆盖度，难以全面解析复杂样本中的低丰度蛋白或动态变化的蛋白质网络。而深度蛋白质组学则通过多层次优化策略，如超高效液相色谱（UHPLC）分级、高分辨率串联质谱（HR-MS/MS）、单细胞蛋白质组学及智能生物信息学分析等实现对生物体系的更深入解析。例如，在神经科学研究中，深度蛋白质组学能够解析神经元的蛋白表达谱及其动态变化，揭示阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病的分子机制。此外，在癌症研究中，这项蛋白质组学分析可识别肿瘤微环境的关键蛋白质变化，为精准治疗提供潜在靶点。

深度蛋白质组学的研究流程涵盖多个关键步骤，包括高效样本制备、蛋白质消化、多维分离、质谱检测及数据分析。首先，在样本制备阶段，采用适合不同生物样本的蛋白提取策略，如组织裂解、膜蛋白富集或单细胞蛋白组分析，以尽可能减少样本损失并提高低丰度蛋白的检测能力。随后，利用多级分离策略（如高pH反相色谱、亲水相互作用色谱等）对复杂蛋白样本进行分级，减少样本复杂性，从而提高检测覆盖度。在质谱分析阶段，深度蛋白质组学通常采用Orbitrap、TOF-MS或离子淌度质谱（TIMS-MS）等高分辨率平台实现高精度蛋白质鉴定及定量分析。而在数据处理方面，结合深度学习、机器学习及多组学整合分析可以更精准地解析蛋白质功能网络及其在生物过程中的作用。

随着单细胞蛋白质组学、多组学整合分析及高通量计算技术的发展，深度蛋白质组学正进入一个前所未有的精细化研究阶段。单细胞蛋白质组学能够解析个体细胞层面的蛋白表达特征，从而揭示细胞间的异质性及动态变化。例如，在免疫学研究中，该技术可以区分不同免疫细胞亚群的蛋白质表达特征，解析免疫应答的分子机制。而多组学整合分析则通过整合基因组学、转录组学、代谢组学及蛋白质组学数据，构建全方位的生物网络模型，以更系统地解析疾病发生发展机制。此外，人工智能及深度学习技术的引入，使得蛋白质组数据的处理、模式识别及功能预测能力大幅提升，加速高价值生物信息的挖掘及转化应用。

百泰派克生物科技依托先进的蛋白质组学研究平台，提供高通量、高灵敏度的蛋白质组学分析服务。我们致力于为客户提供全面的蛋白质组学解决方案，包括低丰度蛋白检测、翻译后修饰分析、多组学整合及精准医学研究。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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